Kann nicht behaupten dass so was normal ist. Habe allerdings erst knapp 5 Jahre Home Assistant am Start. 
Wobei natürlich da vieles zusammen spielt. Angefangen von der verwendeten Hardware bis zu den unterschiedlichen Integrationen und Add-ons, bis hin hin zu allen möglichen Custom Zeug.
Aber ein reboot tut immer gut. 
Ja, solltest Du definitiv Update.
Das sagt auch Dein ZigBee2MQTT Log.
Nach dem Update musst Du dann den adapter auf ember umstellen, also anstatt:
adapter: ezsp
dann
adapter: ember
verwenden.
Gruß
Osorkon